Theodor Pooli muuseumi kogud keskenduvad tema elule ja tegevusele Eesti poliitika- ja põllumajandusajaloo taustal. Kogus leidub isiklikke esemeid, töövahendeid, arhiivimaterjale, fotosid ja kirjavahetust, mis kajastavad Pooli kui riigimehe, teadlase ja taluomaniku mitmekülgset pärandit. Suur osa esemetest on pärit Piistaoja talust ning on muuseumile annetatud Theodor Pooli perekonna poolt.
Arhiivimaterjalid - dokumendid, kirjavahetused, käsikirjad, päevikud, karjaraamatud, talumajapidamise aruanded, joonised, kaardid jne.
Raamatukogu. Kogus leidub eesti- ja võõrkeelset põllumajandusalast kirjandust 1850. aastatest kuni 1941. aastani. Väiksemas mahus on esindatud ka samast perioodist pärit ilukirjandus ning nõukogudeaegne põllumajandusteemaline kirjavara.
Fotod ja negatiivid. Theodor Pooli fotokogu hõlmab ülesvõtteid talu argipäevast, perekonnast ning reisidest nii Eestis kui ka teistes riikides.
Mööbel. Muuseumi kogus on säilinud Theodor Poolile kuulunud originaalne mööbel, sealhulgas Olev Siinmaa projekteeritud kabinetikomplekt ja Luterma vabrikus valmistatud mööbel.
Auhinnad ja isiklikud esemed. Muuseumi kogus on säilitatud Piistaoja talule omistatud auhinnad, sealhulgas "Külvaja" kuju, diplomid ja aumedalid. Samuti kuuluvad kogusse mitmed isiklikud esemeid – prillid, õmblusmasin, fotoaparaat, kirjutusmasin ja muud igapäevased tarbeesemed, mis peegeldavad talu argipäeva.